Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms