Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms