Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms