Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms