Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMILIN3Q9NT22 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms