Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms