Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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