Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms