Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms