Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms