Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms