Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms