Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC46A2Q9BY10 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC46A2Q9BY10 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms