Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms