Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms