Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms