Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms