Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms