Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms