Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms