Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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