Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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