Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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