Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms