Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms