Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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