Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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