Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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MKRN3Q13064 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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