Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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