Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms