Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms