Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAP2Q03519 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms