Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms