Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms