Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms