Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NESP48681 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NESP48681 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NESP48681 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NESP48681 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NESP48681 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NESP48681 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NESP48681 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms