Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms