Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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