Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms