Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1P21675 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1P21675 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1P21675 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms