Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms