Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms