Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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