Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms