Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms