Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LHX3Q9UBR4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms