Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms