Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A3Q9HC58 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms