Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms