Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms